組織樣本的高深度乳酰化修飾組學及蛋白組學檢測采購公告
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公告摘要
各有關單位請于2025.12.12前與公告中聯系人聯系，及時參與投標等相關工作，以免錯失商業機會。
部分信息內容如下：（查看詳細信息請登錄）
組織樣本的高深度乳酰化修飾組學及蛋白組學檢測
品牌：無
貨號/型號：無
規格：無
查看偏離表 * 例 （一）乳酰化修飾組： ▲*、對*例大鼠肺部組織樣本進行蛋白提取與質控檢測，每例檢測消耗大鼠肺部組織樣本量< **mg，對符合實驗要求的蛋白進行胰酶酶解。 ▲*、利用乳酰化抗體偶聯樹脂對乳酰化修飾肽段進行富集。 ▲*、質控要求： ①酶切效率：漏切比率＜**%，含C肽段占比＞**%； ②各樣品總質譜強度值（Intensity）偏差＜**%。 ▲*、技術方法要求：采用高深度修飾組學技術開展高靈敏度、高分辨率的質譜分析。 ▲*、深度要求：鑒定深度總位點數達到****。 ▲*、平臺要求：采用Orbitrap Astral或timsTOF HT質譜儀。 *、配置：DIA-NN搜索引擎，默認控制錯誤發現率（FDR）在蛋白（protein）、肽段（peptide）、肽段譜圖匹配（PSM）三個層面均設置為*％。 *、質譜下機數據篩選質控要求： ①鑒定到肽段長度分布主要分布在*-**個氨基酸，符合基于胰酶酶解和質譜碎裂方式的一般規律； ②質譜儀的質量精準分布需一級質量誤差在** ppm以內； ③儀器HeLa質控的皮爾森（pearson）系數指標大于*.*。 *、對質譜鑒**果進行標準生物信息學分析： ①質量控制包括：肽段長度分布、修飾位點個數分布、定量分布、定量重復性分析（RSD、Pearson）、定量PCA分析、修飾位點強度值分布； ②注釋包括：蛋白功能描述、GO功能分類、蛋白結構域、KEGG通路、COG/KOG功能分類、亞細胞結構定位； ③功能分類包括：GO二級分類、亞細胞結構注釋分類、COG/KOG分類、KEGG功能分類； ④功能富集分析包括：GO富集、KEGG通路富集、蛋白結構域富集； ⑤富集聚類分析包括：GO功能分類、KEGG通路、蛋白結構域； ⑥修飾位點分析：修飾位點序列特征Motif； ⑦網絡分析：蛋白互作網絡； ⑧酶活性預測、分子分型、機器學習、分子對接、藥物靶預測、可藥性分析。 ▲**、個性化生物信息分析：分子對接（需提供分析圖展示）。 （二）蛋白組： ▲*、對*例大鼠肺部組織樣本開展高深度的定量蛋白組學檢測 *、對大鼠肺部組織樣本進行蛋白提取與質控檢測，對符合實驗要求的蛋白進行胰酶酶解。 ▲*、質控要求： ①酶切效率：漏切比率＜**%，含C肽段占比＞**%； ②各樣品總質譜強度值（Intensity）偏差＜**%。 *、技術方法要求：采用高深度定量蛋白質組學技術開展高靈敏度、高分辨率的質譜分析。 ▲*、深度要求：蛋白總體鑒定深度達到****以上。 ▲*、平臺要求：采用Orbitrap Astral質譜儀。 *、質譜下機數據篩選質控要求： ①肽段分布在*-**個氨基酸，符合基于酶解和質譜碎裂方式的一般規律； ②鑒定蛋白的分子量在不同階段均有，大部分蛋白的分子量分布在**-*** kDa； ③質譜儀的質量精準分布需一級質量誤差在** ppm以內； ④儀器HeLa質控的皮爾森（pearson）系數指標大于*.*。 *、對質譜鑒**果進行標準生物信息學分析： ①質量控制包括：肽段長度分布、蛋白覆蓋度分布、蛋白分子量分布、定量分析、定量重復性分析（RSD、Pearson）、定量PCA分析、蛋白強度值分布； ②注釋包括：蛋白功能描述、GO功能分類、蛋白結構域、KEGG通路、COG/KOG功能分類、亞細胞結構定位； ③功能分類包括：GO二級分類、亞細胞結構注釋分類、COG/KOG分類、KEGG通路分類； ④功能富集分析包括：GO富集、KEGG通路富集、蛋白結構域富集； ⑤富集聚類分析包括：GO分類、KEGG通路、蛋白結構域； ⑥網絡分析：蛋白互作網絡； ⑦分子分型、機器學習、分子對接、藥物靶預測、可藥性分析。 ▲*、個性化生物信息分析：分子對接（需提供分析圖展示）。 內容公告 附件信息 附件：大鼠肺組織樣本的高深度乳酰化修飾組學及蛋白組學檢測項目-技術及商務要求.docx
采購單位:某**科研院所
報名網址：https://bidweb.casmart.com.cn/#/frontStation/purchaseDetailid=*****&keys=*
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